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臺南市政府環境保護局組織架構圖 本組織架構圖內容為臺南市政府環境保護局之層級架構,由上而下為:局長、副局長、主任秘書。
主任秘書下設專門委員及簡任技正,並同時督導五室及九科。

五室

  1. 勞工衛生安全室
  2. 秘書室
    • 事務股
    • 研考股
  3. 人事室
  4. 會計室
  5. 政風室

九科

  1. 綜合規劃科
    • 環境教育股
    • 環境評估股
  2. 空氣及噪音管理科
    • 空氣品質管理股
    • 固定汙染源管理股
    • 移動汙染源管理股
  3. 水域及毒物管理科
    • 水質保護股
    • 毒物及環藥管理股
  4. 一般廢棄物管理科
    • 資源再利用股
    • 處理設施維護股
    • 一般廢棄物管理股
  5. 事業廢棄物管理科
    • 清除處理機構管理股
    • 事業廢棄物管理股
  6. 土壤污染管理科
    • 土水防治股
    • 非法棄置管理股
  7. 清淨家園管理科
    • 環境衛生股
    • 隊務管理股 - 區清潔隊
  8. 稽查檢驗科
    • 環境稽查股
    • 檢驗裁決股
  9. 環境淨零永續科