【本局沿革】

台灣光復後成立台南市衛生清道隊，辦理業務僅有路面清掃水溝清理等工作，垃圾及水肥清理則由民間承包。卅八年一月改制為台南市警察局清道隊，接原由民間經營之垃圾清理工作，卅八年十月改制為台南市警察局衛生隊，卅九年一月擴大編制接收原由市農會經營之水肥清理業務。當時因本市郊外農地貧瘠，化學肥料缺乏而昂貴，農民已使用廉價垃圾，水肥有機肥料來改善土壤，因此辦理配售垃圾、水肥所得價款，以自給自足編列預算支應整理環境衛生所需一切費用。至四十年五月因編制未蒙省府核准 ，乃將水肥處理業務移出改編為兩個單位，令組織直屬市府之台南市水肥處理委員會專責水肥處理工作，五十三年四月衛生隊改隸衛生局 ，稱台南市衛生局清潔隊，至六十一年四月一日奉台灣省政府命令合併台南市衛生局清潔隊與台南市水肥處理委員會，改制為台南市清潔管理所，以水肥處理委員會會址為所址。由於辦公廳舍過於狹小而破舊無法容納合併後之組織成員，迨至六十九年三月採用「以產置產」方式，動用二三，五五六，○○元，在中華東路二段133巷72號 ,興建三層樓辦公室及停車場、汽車保養場，新址建平八，五一五平方公尺，全部工程於七十年六月完成，旋於六月二十二日遷入新址辦公。七十七年九月一日奉台灣省政府命令，改制為台南市環境保護局。

本巿位居台灣西南，方中心位置東經１２０１１５４ ，北２２５９２６。東鄰台南縣仁德鄉、永康巿；西淙台灣海峽 ，與澎湖島遙遙相對；北界曾文與台南縣安定鄉相連：南隔二層 行溪與高雄縣湖內鄉接攘。極東為東經１２０１４１０（本巿東區後甲里） ，極西為東經１２０３００（安南區城西里），極南為北緯２３５１２（安南區曾文溪南岸）。